Война Святого Грааля: жестокая битва между магами, в которой семь мастеров и их призванные слуги сражаются за Святой Грааль, волшебный артефакт, способный исполнить любое желание победителя. Почти 10 лет назад последняя битва Четвертой Войны Святого Грааля нанесла ущерб городу Фуюки и унесла более 500 жизней, оставив город опустошенным.

Эмия Широ, переживший эту трагедию, стремится стать героем справедливости, как его спаситель и приемный отец, Эмия Кирицугу. Несмотря на то, что он всего лишь студент, Широ оказывается вовлеченным в Пятую Войну Святого Грааля, когда он случайно видит битву между слугами в школе и вызывает своего собственного слугу, Сэйбер.

Когда таинственная тень начинает кровопролитие в городе Фуюки, Широ присоединяется к Рин Тоосака, товарищу-участнику Войны Святого Грааля, чтобы остановить гибель бесчисленного количества людей. Однако чувства Широ к его близкой подруге Сакуре Мато заводят его глубже в темные секреты, связанные с войной и враждующими семьями.