Война, бушевавшая между Церковью и Ведьмами на протяжении пяти столетий, наконец закончилась миром, но всего несколько лет назад. Однако, укрытые в темных уголках мира, угли того векового конфликта все еще тлеют.

В Королевской академии магии Королевства Вениас учится борющийся студент по имени Сейбл, который не помнит своего времени до зачисления. По приказу директора Альбуса он покинул Королевство, чтобы отправиться в южные районы континента, где антимагические повстанцы все еще являются силой, с которой нужно считаться, в рамках специального режима обучения. Его сопровождает группа людей, сильных как способностями, так и личностью; есть та, известная как Ведьма Рассвета, Ру Кристасс, которая ищет запретное знание первобытной магии в «Гримуаре Зеро», гениальная девушка Хольц, а также единственный зверь школы, Кудд.

Какую правду они откроют в своем путешествии на юг...?