В аниме "Ведьма и чудовище" рассказывается история двух необычных персонажей, прибывших в город на поезде. Один из них — внушительного роста мужчина, несущий на плечах огромный гроб, а второй — молодая девушка с сложным характером. Они являются агентами Ордена магического резонанса, организации магов, задачей которой является решение магических проблем. Эти двое приехали в мирный и процветающий город, находящийся под покровительством могущественной защитницы, с целью выполнить опасное задание: уничтожить ведьму, о которой ходят слухи в этом городе. Однако, как оказывается, местная героиня, неустанно защищающая жителей, и есть та самая ведьма. Это открытие заставляет Ашафа и Гидо задуматься: действительно ли ведьмы — это абсолютное зло, которое нужно истребить? Ответ на этот вопрос им предстоит найти в своём путешествии.