В мире Наруто два года прошли незамеченными. Бывшие новобранцы присоединились к группе опытных шиноби в звании тюнин и джоэн. Главные герои не сидели на месте - каждый из них стал учеником одного из легендарных саннинов - трех великих ниндзя Конохи. Оранжевый парень продолжал учиться у мудрого, но эксцентричного Джирайи, постепенно поднимаясь на новый уровень боевых навыков. Сакура перешла к помощнику и доверенным лицам целителя Тсунаде - нового лидера листовой деревни. Что ж, Саске, чья гордость привела к его изгнанию из Конохи, заключил временный союз со зловещим Орочимару, и все думают, что он пока использует только другого.