Знатоки знают, что ниндзюцу не умер в эпоху Токугава, а ушел в тень, распространяя слухи о его кончине. Теперь ниндзя служат правительству и готовят их под видом обычных школ, и Токийская Академия Ханзо - одна из них. Пять девушек учатся под руководством Кирии Сенсея: деревенская Аска, воспитанная Икаруга, свободная Кацураги, одноглазая Ягю и милашка Хибари. Аска только что сдала следующий экзамен, и, чтобы отметить это событие, Сенсей отправляет студентов с, казалось бы, простой миссией в торговый район. Оказалось, что в Японии много девушек-ниндзя, и не все из них одержимы идеалами добра, справедливости и государственной службы.