Мисаки Такахаси - ученик средней школы, который готовится к вступительным экзаменам в престижный университет. Чтобы уменьшить стресс во время учебы, он принимает помощь лучшего друга, старшего брата и известного писателя Акихико Усами. Однако Масаки собирается узнать, что книги Усами относятся к очень  неприличному жанру, и что внутри Масаки может просыпаться что-то неприличное.

Junjou Romantica также следует за историей двух других пар, слабо связанных с «Romantica» Масаки и Усами.

Egoist показывает очень страстные, но часто сложные отношения между профессором университета Хироки Камидзё (чья жизнь достигла рекордно низкого уровня) и педиатром Новаки Кусамой, который влюбляется в Хироки с первого взгляда и сделает все, чтобы сделать его счастливым.

Третья история, «Террорист», показывает, насколько одержимой может стать любовь, когда богатый восемнадцатилетний Синобу Такацуки, наконец, обнаруживает то, что ему нелегко получить, - профессора литературы Ю Мияги.

Эти три пары полны страсти, пытаясь достичь своих целей в жизни, одновременно впадая в искушение и страдания со своими партнерами.