Действие аниме "Мои девушки 2" разворачивается непосредственно после событий первого сезона. Главный герой, школьник Наоя Мукай, наконец-то завоевал сердце Саки, своей подруги детства. После многочисленных признаний он достиг своей цели и считает себя самым счастливым человеком на свете. Однако, его преданность будет подвергнута неожиданному испытанию, когда его одноклассница Мукай Нагиса признается ему в своих чувствах.

Возникает странный романтический треугольник, где трое влюбленных оказываются в запутанной ситуации. Хотя это может показаться парадоксальным, события развиваются дальше. Как будут развиваться отношения главных героев? Саки и Наоям может прийти конец? Какое решение примет главный герой и какие последствия это повлечет? Наоя приходится сталкиваться с собственными противоречивыми чувствами, а также с проблемами, связанными с наличием двух девушек в его жизни. Возможно, ему было достаточно просто сказать "нет", но можно понять его сложную ситуацию. Однако, он все равно принимает поспешное и необдуманное решение, которое повлияет на его жизнь.